Nagisa, seorang pekerja muda yang bekerja di jabatan perakaunan dan penuh dengan rasa keadilan, mempunyai keraguan tentang pemprosesan perbelanjaan yang tidak telus di dalam syarikat dan mula menyiasatnya. Walau bagaimanapun, di sebalik syarikat itu terdapat projek rahsia terlarang yang dipanggil "Projek N". Nagisa, yang dipanggil atas nama latihan, secara beransur-ansur dilatih dari segi mental dan fizikal oleh pegawai kanan lelaki di dalam syarikat.